Princíp partnerstva (komplementarity)

Obsahuje požiadavku aktívnej účasti príslušných orgánov všetkých úrovní na príprave, uskutočňovaní a monitorovaní výsledkov projektov, ktoré sú súčasťou regionálnej politiky a sú spolufinancované z prostriedkov  štrukturálnych fondov. V praxi to znamená, že pri realizácii projektov je potrebná úzka spolupráca medzi jednotlivými úrovňami orgánov na európskej, národnej, regionálnej a miestnej úrovni. Partnerstvo má dve dimenzie: horizontálnu a vertikálnu. Horizontálna dimenzia kladie dôraz na spoluprácu všetkých zainteresovaných subjektov v regióne, t.j. aktérov z verejného, súkromného a tretieho sektora. Vertikálna dimenzia hovorí, že do prípravy, realizácie a evaluácie rozvojových programov musia byť zapojené všetky dotknuté hierarchické štruktúry (Európska Komisia, vlády členských štátov, ministerstvá, regionálni a lokálni partneri).